현재 전국의과대학에서 의학전문대학원으로의 학제개편 등에 대해서 논의가 진행되고 있음은 명백하다. 그러나 지금까지 확정된것은 없고 학장협의회 등을 통해서 앞의로의 문제점들에 대해서 토의하고 있다. 경희의대는 교수들의 의견을 수렴한 결과 2004년에 도입, 2년뒤인 2006년 부터 의학전문대학원생의 입학을 추진할 계획을 가지고 있다. 의예과의 존속 및 폐지에 대해서는 아직 결정한바 없으며, 이 문제는 교수, 학생 및 동문들과 폭넓은 대화를 통해서 결정할 예정이다. 의학과에서는 의학전문대학원으로의 전환에 대한 진행과정을 수시로 홈페이지에 보고할 예정이다.